天澤院は室町時代に悟渓和尚（瑞龍寺開山）が禅学布教のために
大徹堂（現在の禅堂）を創立したのがはじまりとされています。
永禄元年（1558）に、別庵を建立して瑞微庵と号し、法孫である天瑞和尚によって開基されました。
天瑞和尚の後九世住職が続きましたが、その後は無住となりました。

江戸時代になり文化2年(1805)、名僧隠山和尚によって庵号を天沢庵と改め、
雲水が修行する僧堂である叢林を開くと、天下の雲水が集まる道場となって、
地方精神文化の発祥地として宗風を大いに振るいました。
明治24年(1891)、濃尾大震災のために諸堂が倒壊、翌年の4月に僧堂を瑞龍寺の境内に移転しました。
大正12年(1923)の仙室和尚の代に本堂・庫裡が再建されたことで本来の姿に戻りました。
そして昭和10年2月、寺号を現在の天澤院と改称しました。
昭和20年には岐阜市大空襲の戦災によって諸堂宇がことごとく焼失してしまいましたが、
檀信徒たちのお力によって本堂・庫裡を再建することができました。

その後、五十有余年を経た平成10年12月、22ヵ月に渡る工事を終え、本堂を改築。
現在は多賀 正浩和尚を経て、天安 宗道和尚が法務を取り行っております。